Yüksek yoğunluklu akuakültür tesislerinde su kalitesi, üretim verimliliğini doğrudan belirler. Çözünmüş oksijen düşüklüğü, nitrit birikimi ve patojen yükü; balık sağlığını tehdit eder ve antibiyotik kullanımını artırır. Bilimsel veriler ozonun RAS (Kapalı Devir Daim Sistemleri) üzerindeki etkisini açıkça ortaya koymaktadır: 25–39 g ozon/kg yem besleme dozu, RAS su kalitesinde askıda katı madde (AKM) yükünü %35, KOİ'yi %36, rengi ise %82 oranında düşürmektedir (Summerfelt ve ark., 1997). Aynı çalışmada nitrit konsantrasyonu kültür tankı içinde %82 azalmış; amonyak %61, nitrit %78 oranında giderilebilmektedir. Türkiye'nin ilk 50 Nm³/saat O₂ + 400 g/saat ozon entegre akuakültür sistemi OCS Ozon tarafından Gümüşdoğa Keban tesisinde kurulmuştur.
Deniz Ürünleri İşleme: Taze balık ve deniz ürünleri işleme tesislerinde mikrobiyolojik yük, koku ve yüzey kontaminasyonu, ürün kalitesi ve raf ömrünü doğrudan belirler. Vibrio, Listeria ve toplam mezofilik aerobik bakteri (TMAB) yükü, işleme hattının tüm aşamalarında kritik kontrol noktalarını oluşturur. Ozon teknolojisi; işleme hattı yüzeyleri ve ekipmanlarda %99'un üzerinde bakteri inaktivasyonu sağlarken taze balık etinde renk, doku ve duyusal özellikleri korur. Düşük konsantrasyonlu ozonlu su ile yapılan balık yüzeyi yıkamaları, toplam bakteri sayısını 1–3 log azaltmakta ve soğutmalı depolamada raf ömrünü 2–4 gün uzatmaktadır (çeşitli deniz ürünleri ozon uygulaması çalışmaları). Proses suyu ve buzhanelerde ozon entegrasyonu, çapraz kontaminasyon riskini minimize eder.